На отделении ведется подготовка по специальности 25.02.04 Летная эксплуатация летательных аппаратов.
Зимой 1969 года Омское училище спецслужб получило приказ Министерства гражданской авиации об организации Летного отделения для подготовки пилотов на самолете Ан-2 с учетом потребностей Аэрофлота.
Изначально, формирование летного отделения осуществлялось из организации цикловых комиссий для теоретической подготовки будущих курсантов училища (наименование того времени).
Приказом директора, были образованы следующие цикловые комиссии:
- самолетовождения и организации летной работы, под председательствованием Ребрей А.Г.
- конструкции самолета Ан-2 и двигателя АШ-62Ир.
Первым заведующим лаборатории цикловой комиссии «самолетовождения» был Попов М.П. Первым заведующим лаборатории конструкции самолета Ан-2 и двигателя 62ИР назначен Квасов Н.А.
К началу учебного года цикловые комиссии полностью были готовы к проведению занятий с курсантами. Вся работа по изготовлению наглядных пособий и оборудованию классов легла на лаборатории цикловых комиссий. Руками коллектива в короткий срок было изготовлено около двухсот схем для занятий с курсантами, препарированы изучаемые пилотажно-навигационные приборы и изготовлены стенды действующих макетов, приборов и радиостанций.
В настоящее время, летное отделение возглавляет Стрельцов Виктор Андреевич, преподаватель высшей категории. Основное направление работы данного подразделения - подготовка пилотов на различные типы вертолетов (Ми-8Т, Ми-8МТВ и др.).